نرم افزار
gromacs نسخه
5.1 بر روی کلاستر نصب شد. این نرم افزار که برای محاسبات مولکولی و بایو استفاده می شود، قابلیت اجرای موازی را با استفاده از استاندارد MPI دارد. برای آگاهی از نحوه اجرای برنامه با استفاده از job manager به فایل راهنمای زیر مراجعه کنید.