اجرای Flow-3d در محیط گرافیکی

نرم افزار Flow-3d نسخه 11 بر روی کلاستر نصب شد. برای آگاهی از نحوه اجرای برنامه لطفا فایل راهنمای آن را مطالعه کنید.

نسخه اول 05-10-95
حجم: 405 کیلوبایت

اجرای Matlab در محیط گرافیکی

همان طور که قبلا گفته شد، امکان اجرای نرم افزار Matlab با رابط گرافیکی فراهم شده است. برای دریافت راهنما، فایل زیر را مطالعه کنید.

نسخه اول 04-09-95
حجم: 366 کیلوبایت

اجرای Abaqus در محیط گرافیکی

همان طور که قبلا گفته شد، امکان اجرای نرم افزار Abaqus با رابط گرافیکی فراهم شده است. برای دریافت راهنما، فایل زیر را مطالعه کنید.

نسخه دوم 21-01-96
حجم: 295 کیلوبایت

لینک آپارات

اجرای Ansys/Fluent در محیط گرافیکی

همان طور که قبلا گفته شد، امکان اجرای نرم افزار Ansys/Fluent با رابط گرافیکی فراهم شده است. برای دریافت راهنما، فایل زیر را مطالعه کنید.

نسخه اول 03-09-95
حجم: 428 کیلوبایت

اجرای برنامه های با محیط گرافیکی

به منظور تسهیل استفاده از کلاستر، اخیراً این امکان فراهم شده است که برنامه هایی مانند

• Ansys/Fluent
• Abaqus
• Matlab
• Mathematica
• Flow-3d
  

که نیاز به محیط گرافیکی (GUI) دارند، بتوانند در فضای کلاستر اجرا شوند. برای این منظور، لازم است کاربران یک محیط دسکتاپ داشته باشند. برای اطلاع از چگونگی اضافه شدن دسکتاپ به حساب کاربری، راهنمای مشاهده دسکتاپ با vnc را مطالعه کنید. به تدریج راهنمای برنامه ها در وبلاگ بارگذاری خواهند شد.

نرم افزار gromacs

نرم افزار gromacs نسخه 5.1 بر روی کلاستر نصب شد. این نرم افزار که برای محاسبات مولکولی و بایو استفاده می شود، قابلیت اجرای موازی را با استفاده از استاندارد MPI دارد. برای آگاهی از نحوه اجرای برنامه با استفاده از job manager به فایل راهنمای زیر مراجعه کنید.

نسخه اول 20-07-95
حجم: 128 کیلوبایت

نرم افزار siesta

نسخه های 3.2 و 4.0 از نرم افزار SIESTA که یک نرم افزار شیمی محاسباتی است و برای محاسبات مولکولی و سنتز مواد از آن استفاده می شود، بر روی کلاستر نصب شدند. از آن جایی که نسخه نصب شده از کتابخانه MPI استفاده می کند، اجرای موازی آن بر روی کلاستر امکان پذیر است. برای اطلاع از نحوه اجرای برنامه های siesta و transiesta، فایل راهنمای زیر را ملاحظه فرمایید. وجود این دو نسخه برای تسهیل کار کاربران است که در صورتی که کد قدیمی تر دارند بتوانند با نسخه 3.2 اجرا کنند و در صورتی که بخواهند از ویژگی های جدید نرم افزار استفاده کنند، بتوانند نسخه 4.0 را اجرا کنند.

نسخه سوم 20-07-95
حجم: 136 کیلوبایت

برنامه مدیر کار

اجرای برنامه بر روی کلاستر علاوه بر این که نیاز به دانستن پایه سیستم عامل لینوکس دارد، نیاز به دانستن معلومات اضافه نیز هست. این دانش به این خاطر مورد نیاز است که در محیط کلاستر، فقط یک گره پردازشی وجود ندارد و علاوه بر گره پردازشی اصلی (که با اسامی server یا head node یا frontend شناخته می شود)، چند گره پردازشی دیگر نیز وجود دارند و همین تعد گره های پردازشی است که قابلیت های یک کلاستر را افزایش می دهند. در عین حال کاربران فقط به بک گره اصلی متصل می شوند و به همین خاطر این سئوال مطرح می شود که چگونه می توان بر روی گره اصلی یک برنامه اجرا کرد به طوری که از امکانات پردازشی سایر گره ها نیز استفاده کرد.

برای این که کاربران به صورت مستقیم درگیر چنین مسائلی نباشند، یک برنامه به نام مدیر کار (job manager) به نام TORQUE وجود دارد که این کار را انجام می دهد و کاربر فقط باید مشخصات برنامه مورد نظر خود را برای اجرا، به این برنامه مدیر کار معرفی کند.

در همین راستا، یک راهنما در مرکز پردازش های سریع تهیه شده است تا کاربران نحوه اجرای برنامه ها را بر روی کلاستر فرا گیرند. این راهنما حاوی مثال های ساده به همراه توضیحات لازم است که به راحتی قابل بررسی و تست هستند.

نسخه اول 15-04-95
حجم: 176 کیلوبایت

راهنمای شروع کار

برای آگاهی از روال خدمات مرکز و درخواست سرویس، به صفحه شروع مراجعه کنید و راهنما را مطالعه کنید.

نرم افزار Gaussian

نرم افزار Gaussian با نام g09 که یک نرم افزار شیمی محاسباتی است و برای محاسبات مولکولی و سنتز مواد از آن استفاده می شود، بر روی کلاستر نصب شد. فایل راهنمای زیر مراحل لازم برای اجرای برنامه Gaussian را با توجه به برنامه مدیر slurm توضیح می دهد.

نسخه اول-10-02-1397
حجم: 268 کیلوبایت