نرم افزار gromacs

نرم افزار gromacs نسخه 5.1 بر روی کلاستر نصب شد. این نرم افزار که برای محاسبات مولکولی و بایو استفاده می شود، قابلیت اجرای موازی را با استفاده از استاندارد MPI دارد. برای آگاهی از نحوه اجرای برنامه با استفاده از job manager به فایل راهنمای زیر مراجعه کنید.

نسخه اول 20-07-95
حجم: 128 کیلوبایت

نرم افزار siesta

نسخه های 3.2 و 4.0 از نرم افزار SIESTA که یک نرم افزار شیمی محاسباتی است و برای محاسبات مولکولی و سنتز مواد از آن استفاده می شود، بر روی کلاستر نصب شدند. از آن جایی که نسخه نصب شده از کتابخانه MPI استفاده می کند، اجرای موازی آن بر روی کلاستر امکان پذیر است. برای اطلاع از نحوه اجرای برنامه های siesta و transiesta، فایل راهنمای زیر را ملاحظه فرمایید. وجود این دو نسخه برای تسهیل کار کاربران است که در صورتی که کد قدیمی تر دارند بتوانند با نسخه 3.2 اجرا کنند و در صورتی که بخواهند از ویژگی های جدید نرم افزار استفاده کنند، بتوانند نسخه 4.0 را اجرا کنند.

نسخه سوم 20-07-95
حجم: 136 کیلوبایت

برنامه مدیر کار

اجرای برنامه بر روی کلاستر علاوه بر این که نیاز به دانستن پایه سیستم عامل لینوکس دارد، نیاز به دانستن معلومات اضافه نیز هست. این دانش به این خاطر مورد نیاز است که در محیط کلاستر، فقط یک گره پردازشی وجود ندارد و علاوه بر گره پردازشی اصلی (که با اسامی server یا head node یا frontend شناخته می شود)، چند گره پردازشی دیگر نیز وجود دارند و همین تعد گره های پردازشی است که قابلیت های یک کلاستر را افزایش می دهند. در عین حال کاربران فقط به بک گره اصلی متصل می شوند و به همین خاطر این سئوال مطرح می شود که چگونه می توان بر روی گره اصلی یک برنامه اجرا کرد به طوری که از امکانات پردازشی سایر گره ها نیز استفاده کرد.

برای این که کاربران به صورت مستقیم درگیر چنین مسائلی نباشند، یک برنامه به نام مدیر کار (job manager) به نام TORQUE وجود دارد که این کار را انجام می دهد و کاربر فقط باید مشخصات برنامه مورد نظر خود را برای اجرا، به این برنامه مدیر کار معرفی کند.

در همین راستا، یک راهنما در مرکز پردازش های سریع تهیه شده است تا کاربران نحوه اجرای برنامه ها را بر روی کلاستر فرا گیرند. این راهنما حاوی مثال های ساده به همراه توضیحات لازم است که به راحتی قابل بررسی و تست هستند.

نسخه اول 15-04-95
حجم: 176 کیلوبایت

نرم افزار Gaussian

نرم افزار Gaussian با نام g09 که یک نرم افزار شیمی محاسباتی است و برای محاسبات مولکولی و سنتز مواد از آن استفاده می شود، بر روی کلاستر نصب شد. فایل راهنمای زیر مراحل لازم برای اجرای برنامه Gaussian را با توجه به برنامه مدیر slurm توضیح می دهد.

نسخه اول-10-02-1397
حجم: 268 کیلوبایت

نرم افزار OpenFoam

نرم افزار OpenFoam نسخه 2.3.0 بر روی سرور نصب شد. برای آگاهی از نحوه اجرای آن، فایل راهنمای زیر را مشاهده کنید.

دریافت
حجم: 175 کیلوبایت

نرم افزار MATLAB

برای اطلاع از نحوه اجرای برنامه MATLAB بر روی سرور و کار کردن با برنامه مدیر کار، فایل راهنمای زیر را مشاهده کنید.

نسخه سوم 10-04-95
حجم: 718 کیلوبایت

مشاهده دسکتاپ با vnc

برای مشاهده دسکتاپ حساب کاربری خود از طریق پروتکل vnc، فایل راهنمای زیر را مشاهده کنید.

نسخه چهارم 01-09-95
حجم: 211 کیلوبایت

لینک آپارات

انتقال فایل به سرور

نحوه کار کردن با نرم افزار WinSCP را برای انتقال فایل از کامپیوتر شخصی به سرور (وبالعکس) از لینک زیر دریافت کنید.

دریافت
حجم: 1016 کیلوبایت

لینک آپارات

اتصال به سرور

نحوه کار کردن با نرم افزار PuTTY برای اتصال به سرور را از لینک زیر دریافت کنید.

دریافت
حجم: 705 کیلوبایت

لینک آپارات