نرم افزار gromacs

نرم افزار gromacs نسخه 5.1 بر روی کلاستر نصب شد. این نرم افزار که برای محاسبات مولکولی و بایو استفاده می شود، قابلیت اجرای موازی را با استفاده از استاندارد MPI دارد. برای آگاهی از نحوه اجرای برنامه با استفاده از job manager به فایل راهنمای زیر مراجعه کنید.

نسخه اول 20-07-95
حجم: 128 کیلوبایت

لوگوی اصلاح شده

با توجه به نظرات به دست آمده در رابطه با لوگوی مرکز، نسخه جدیدی از آن که اصلاح شده نسخه قبلی است، مورد استفاده قرار خواهد گرفت. اولین ویژگی این نسخه، رنگ آن است که سعی کرده ایم مطابق با رنگ لوگوی دانشگاه شهید چمران باشد. دومین ویژگی این نسخه انحنای نوشته ها است تا به این طریق یک شکل دایره ای به لوگو داده شود. با تشکر از آقای محمد امین درخشانی دانشجوی سال سوم رشته کامپیوتر که این تغییرات را اعمال کردند.

نرم افزار siesta

نسخه های 3.2 و 4.0 از نرم افزار SIESTA که یک نرم افزار شیمی محاسباتی است و برای محاسبات مولکولی و سنتز مواد از آن استفاده می شود، بر روی کلاستر نصب شدند. از آن جایی که نسخه نصب شده از کتابخانه MPI استفاده می کند، اجرای موازی آن بر روی کلاستر امکان پذیر است. برای اطلاع از نحوه اجرای برنامه های siesta و transiesta، فایل راهنمای زیر را ملاحظه فرمایید. وجود این دو نسخه برای تسهیل کار کاربران است که در صورتی که کد قدیمی تر دارند بتوانند با نسخه 3.2 اجرا کنند و در صورتی که بخواهند از ویژگی های جدید نرم افزار استفاده کنند، بتوانند نسخه 4.0 را اجرا کنند.

نسخه سوم 20-07-95
حجم: 136 کیلوبایت

برنامه مدیر کار

اجرای برنامه بر روی کلاستر علاوه بر این که نیاز به دانستن پایه سیستم عامل لینوکس دارد، نیاز به دانستن معلومات اضافه نیز هست. این دانش به این خاطر مورد نیاز است که در محیط کلاستر، فقط یک گره پردازشی وجود ندارد و علاوه بر گره پردازشی اصلی (که با اسامی server یا head node یا frontend شناخته می شود)، چند گره پردازشی دیگر نیز وجود دارند و همین تعد گره های پردازشی است که قابلیت های یک کلاستر را افزایش می دهند. در عین حال کاربران فقط به بک گره اصلی متصل می شوند و به همین خاطر این سئوال مطرح می شود که چگونه می توان بر روی گره اصلی یک برنامه اجرا کرد به طوری که از امکانات پردازشی سایر گره ها نیز استفاده کرد.

برای این که کاربران به صورت مستقیم درگیر چنین مسائلی نباشند، یک برنامه به نام مدیر کار (job manager) به نام TORQUE وجود دارد که این کار را انجام می دهد و کاربر فقط باید مشخصات برنامه مورد نظر خود را برای اجرا، به این برنامه مدیر کار معرفی کند.

در همین راستا، یک راهنما در مرکز پردازش های سریع تهیه شده است تا کاربران نحوه اجرای برنامه ها را بر روی کلاستر فرا گیرند. این راهنما حاوی مثال های ساده به همراه توضیحات لازم است که به راحتی قابل بررسی و تست هستند.

نسخه اول 15-04-95
حجم: 176 کیلوبایت

لوگوی مرکز

لوگوی مرکز پردازش های سریع با تلاش آقای محمد امین درخشانی دانشجوی سال سوم رشته نرم افزار دانشکده مهندسی طراحی شد. با تشکر از ایشان که برای این کار وقت گذاشتند.

راهنمای شروع کار

برای آگاهی از روال خدمات مرکز و درخواست سرویس، به صفحه شروع مراجعه کنید و راهنما را مطالعه کنید.

مقدار برپا بودن سرور مرکز

ویژگی جدیدی در وبلاگ اضافه شده است که میزان بر پا بودن (up time) سرور اصلی را نشان می دهد. امید است با افزایش قابلیت دسترسی پذیری سیستم، سرور در مدت زمان بیشتری بر قرار باشد تا امکان سرویس دهی فراهم باشد. برای مشاهده این مقدار می توانید به قسمت "خلاصه آمار" در ستون سمت چپ وبلاگ مراجعه کنید.

نرم افزار Gaussian

نرم افزار Gaussian با نام g09 که یک نرم افزار شیمی محاسباتی است و برای محاسبات مولکولی و سنتز مواد از آن استفاده می شود، بر روی کلاستر نصب شد. فایل راهنمای زیر مراحل لازم برای اجرای برنامه Gaussian را با توجه به برنامه مدیر slurm توضیح می دهد.

نسخه اول-10-02-1397
حجم: 268 کیلوبایت

اسلایدهای سمینار Big Data

روز سه شنبه 4ام خرداد ماه 1395، سمینار یک روزه در رابطه با آشنایی با big data توسط آفای مهندس سید محمد امین ساجدی و با همکاری آقای دکتر محمد جواد رشتی برگزار شد. هدف از برگزاری این سمینار آشنایی مخاطبین با مهفوم و کاربردهای big data بود تا در آینده با برگزاری یک سلسله کارگاه های آموزشی، بیشتر به این پدیده پرداخته شود. اسلایدهای این ارائه را می توانید از لینک زیر دریافت کنید.

دریافت
حجم: 4.08 مگابایت

اطلاعیه برگزاری سمینار Big Data

مرکز پردازش های سریع قصد دارد یک سمینار با عنوان آشنایی با Big Data برگزار کند. این سمینار توسط آقای دکتر محمد جواد رشتی و آقای مهندس سید محمد امین ساجدی ارائه خواهد شد. در ادامه، توجه شما را به توضیح مختصر و اهداف این سمینار جلب می کنیم

هرکدام از ما حکم کارخانه ای را داریم که محصولش داده است. داده هایی که حجمشان در کامپیوتر هرکدام از ما بالغ بر چند صد گیگابایت می باشد. شاید هرکدام از ما همینقدر و شاید بیشتر هم در فضای مجازی داده داشته باشیم. داده هایی که می توانند شخصی هم باشند. متخصصان و صاحبان کسب و کارهای کوچک و بزرگ به این نتیجه رسیدند که این داده ها حکم نفت را دارند و نباید به راحتی از کنار ان ها گذشت. Big Data نامی است که به این مبحث نسبت داده شده است. در بزرگ داده (Big Data) بدنبال این هستیم که یادبگیریم چگونه می توانیم این حجم عظیم از داده ها را ذخیره سازی کنیم، چگونه آن ها را مدیریت کنیم و در نهایت چگونه از این داده ها در پیشبرد اهداف کسب و کار خود نهایت استفاده را ببریم.
 در سمیناری که تحت عنوان "بزرگ داده" برگزار می شود قرار است در مرحله اول به معرفی بزرگ داده پرداخته شود و سپس به معرفی ابزارها و تکنولوژی های موجود اشاره ای اجمالی شود. پس از آن هم به کاربرد بزرگ داده در علوم مختلف پرداخته می شود. همچنین اولین کتاب فارسی ترجمه شده در این زمینه نیز به شرکت کنندگان معرفی می شود.

زمان: سه شنبه 4 خرداد 1395 ساعت 12

مکان: دانشکده مهندسی دانشگاه شهید چمران، کلاس 206